Nos plateformes technologiques
Des équipements de pointe au service de la recherche marine
Spectrométrie de masse haute résolution (HR-MS)
Notre plateforme de spectrométrie de masse permet l'identification et la quantification des composés bioactifs à l'échelle moléculaire. Grâce à une résolution sub-ppm et une sensibilité femtomolaire, nous détectons et caractérisons les saponines triterpéniques, les glycosaminoglycanes et autres métabolites secondaires présents dans les tissus d'holothuries.
Couplée à nos systèmes de chromatographie liquide, cette technologie constitue le socle analytique de notre pipeline de découverte. Elle permet un profilage métabolomique complet et le suivi pharmacocinétique des candidats-médicaments tout au long du développement préclinique.
- Instruments : Orbitrap Exploris 480, Q-TOF 6560 (Agilent)
- Résolution : < 1 ppm, sensibilité femtomolaire
- Capacité : 200 échantillons/jour en mode automatisé
Chromatographie liquide HPLC/UHPLC
La séparation et la purification des fractions bioactives issues des extraits d'holothuries reposent sur notre parc de chromatographes de dernière génération. Les systèmes UHPLC offrent des temps d'analyse réduits de 80 % par rapport à la HPLC conventionnelle, avec une résolution chromatographique supérieure.
Nous exploitons une large gamme de colonnes — C18, HILIC, chirales — associées à des gradients multi-solvants optimisés pour chaque famille de composés marins. Notre ligne préparative semi-automatisée permet d'isoler des quantités milligrammes de fractions pures pour les essais biologiques en aval.
- Instruments : Waters ACQUITY UPLC, Agilent 1290 Infinity II
- Colonnes C18, HILIC, chirales — gradient multi-solvant
- Purification préparative semi-automatisée
- Couplage LC-MS/MS en routine
Séquençage génomique NGS (Next-Generation Sequencing)
Notre centre de génomique assure le séquençage complet des génomes d'holothuries et la métagénomique environnementale des écosystèmes marins. L'approche combinée de séquençage court (Illumina) et long (Oxford Nanopore) permet des assemblages de novo de haute qualité et la détection de variants structuraux complexes.
Ces données génomiques alimentent directement nos programmes de bioprospection, en identifiant les gènes responsables de la biosynthèse des composés thérapeutiques d'intérêt. Le centre de génomique de Singapour, inauguré en 2026, représente un investissement majeur dans cette capacité stratégique.
- Instruments : Illumina NovaSeq 6000, Oxford Nanopore PromethION
- Capacité : 6 Tb/run, assemblage de novo
- Centre de génomique inauguré en 2026 à Singapour
- Analyses transcriptomiques et épigénomiques intégrées
Cristallographie aux rayons X
La détermination de la structure tridimensionnelle des protéines et des composés bioactifs cristallisés est essentielle pour comprendre leurs mécanismes d'action. Notre diffractomètre Rigaku XtaLAB Synergy, combiné à un accès régulier au synchrotron ESRF de Grenoble, permet d'obtenir des structures à résolution atomique.
Ces données structurales guident la conception rationnelle de médicaments (structure-based drug design) et l'optimisation des interactions protéine-ligand pour nos candidats thérapeutiques dérivés des holothuries.
- Instruments : Rigaku XtaLAB Synergy, accès synchrotron ESRF (Grenoble)
- Résolution : jusqu'à 1.2 Å
- Cristallisation robotisée (Mosquito, SPT Labtech)
Microscopie électronique (SEM/TEM/Cryo-EM)
L'imagerie ultrastructurale des tissus d'holothuries et des scaffolds biomatériaux est réalisée grâce à notre parc de microscopes électroniques. La microscopie à balayage (SEM) révèle la morphologie de surface des spicules et des tissus régénérés, tandis que la transmission (TEM) permet l'observation des organites cellulaires.
Notre microscope cryo-EM Titan Krios, avec une résolution de 2 Å, permet la détermination de structures de protéines et de complexes macromoléculaires sans nécessiter de cristallisation — un avantage considérable pour les protéines membranaires d'holothuries difficiles à cristalliser.
- Instruments : JEOL JEM-F200, FEI Titan Krios (cryo-EM)
- Résolution : 2 Å (cryo-EM)
- Préparation d'échantillons vitrifiés automatisée (Vitrobot)
- Analyse tomographique 3D des tissus
Culture cellulaire & Bioassays
Le criblage in vitro des composés bioactifs est réalisé sur lignées cellulaires humaines et modèles tridimensionnels avancés. Notre plateforme de criblage à haut débit (HTS) permet l'évaluation de 100 000 composés par semaine, accélérant considérablement l'identification des hits et des leads thérapeutiques.
Nous disposons de modèles organoïdes tumoraux dérivés de patients et de modèles de peau 3D pour évaluer l'efficacité et la toxicité des candidats-médicaments dans des contextes biologiquement pertinents. L'ensemble de la plateforme opère selon les normes GLP (Good Laboratory Practice).
- Plateforme HTS : 100 000 composés/semaine
- Modèles organoïdes tumoraux, modèles de peau 3D
- Normes GLP certifiées
- Robots de manipulation liquide (Hamilton STAR)
Aquaculture & Reproduction en captivité
L'élevage contrôlé d'holothuries garantit un approvisionnement durable en matière biologique tout en préservant les populations sauvages. Nos installations comprennent 2 400 m² de bassins thermorégulés avec contrôle précis de la salinité, de la température et du photopériodisme pour reproduire les conditions optimales de chaque espèce.
Nos protocoles de reproduction couvrent l'ensemble du cycle de vie, de l'induction de la ponte à l'élevage des juvéniles. Le taux de survie de 78 % pour les juvéniles représente une avancée significative par rapport aux standards de l'industrie aquacole et témoigne de notre expertise en biologie du développement des échinodermes.
- Bassins : 2 400 m² de bassins thermorégulés
- Espèces élevées : H. scabra, S. japonicus, A. japonicus
- Taux de survie : 78 % (juvéniles)
- Programme de réintroduction en milieu naturel
Bioinformatique & Intelligence artificielle
La modélisation moléculaire, le docking protéine-ligand, la prédiction ADMET et l'analyse multi-omique sont au cœur de notre approche computationnelle. Notre cluster HPC de 2 048 cœurs GPU (NVIDIA A100) permet des simulations de dynamique moléculaire à grande échelle et l'entraînement de modèles de deep learning sur des jeux de données massifs.
Nos modèles de machine learning propriétaires, entraînés sur notre base de données exclusive de composés marins, prédisent l'activité biologique, la toxicité et les propriétés pharmacocinétiques des nouveaux candidats avant même leur synthèse. Cette approche in silico réduit considérablement les délais et les coûts de développement.
- Cluster HPC : 2 048 cœurs GPU (NVIDIA A100)
- Logiciels : Schrödinger Suite, AlphaFold, GROMACS
- Modèles ML propriétaires pour prédiction d'activité
- Pipeline d'analyse multi-omique automatisé
Investissement technologique
Un engagement financier massif pour garantir l'excellence scientifique et l'innovation dans chacune de nos plateformes.